“5.12”地震中，博物馆库房和展厅均遭受了很大损失，08年底，国家教育部根据我馆受灾情况，很快划拨一笔专项资金用于灾后重建工作。09年初，本馆立即展开灾后重建的各项工作，针对地震中受损严重的库房紧急实施了藏品的清点和保全、上架措施。并充分利用这批专项资金，将库房陈旧的木质藏品柜架更换为坚固安全的的金属密集柜。这种新型密集柜具有轻便灵活，载荷能力强，操作方便、空间利用率高等特点，满足了文物藏储的防尘、防鼠、 防盗、防潮、防倒的要求。经过与我校国资处的配合，进行了库房密集柜的招投标工作。经多方比较和考察，4月，我馆与中标公司——“四川省永亨实业有限责任公司”签订了《购销协议》。至7月份，经我馆库管人员与安装工人们的通力合作，12个库房的文物密集柜的安装工作顺利完成。同时藏品储存盒的招投标和入柜工作也在加紧进行，12月中旬，此项工作也已全部结束。至此，我馆新一期库房建设初见成效，文物收藏与保管条件得以较大的改善和提高。为今后更高效、安全的文物保存与研究提供了优质的硬件条件。
我馆地震中受损最为严重的是瓷器文物，经统计，共计70余件不同时代的瓷器受到损伤需要修复，部分瓷器损毁甚为严重。地震后在馆领导的带领下，本馆立即着手对部分损伤程度较低的文物进行了修复。此项工作主要依靠本馆技术部自身力量，与库管人员共同合作，经过反复的技术研究和实验，先期完成了展厅受损瓷器和库房部分受损瓷器的修复工作，陈列在3楼瓷器展馆的德化窑白釉观音像，景德镇粉彩人物故事将军罐等7件精美的古代瓷器经过精心修复，现已重新陈列展出。其余受损瓷器仍在加紧修复中。
